2026年9月13日
Kinoshita G., Suda K., Aoki D., Naoki O., Jogahara T., Sato J.J., Yamada F. and Suzuki H. 2025.Island population dynamics since the Late Miocene: comparative phylogeography of mammalian species in three genera (Pentalagus, Diplothrix, and Tokudaia) endemic to the Central Ryukyu Islands. Mammal Study 50:143-158.
Abstract
The Ryukyu Islands have experienced a complex history of island connection and separation since the Late Miocene. Questions persist regarding how organisms have evolved through changes in island configurations over millions of years particularly in the Central Ryukyus, which is characterized by high species endemism. We conducted comparative phylogenetic and phylogeographic analyses among island populations targeting five mammalian species (Pentalagus furnessi, Diplothrix legata, and three Tokudaia species), all of which belong to genera endemic to the Central Ryukyus, employing genome-wide SNP and mitochondrial DNA variation analyses. The SNP and mitochondrial DNA analyses across these genera revealed distinct lineages on each island (Amami-Ohshima, Tokunoshima, and Okinawajima, except for P. furnessi absent from Okinawajima), with the Amami-Ohshima population showing the highest genetic diversity. Divergence times between island populations were estimated to be in the Middle Pleistocene for P. furnessi and D. legata and ranged from the Late Miocene to the Early Pleistocene for Tokudaia. These findings, along with those of previous studies on other terrestrial animals, emphasize the significant impact of pre-Pleistocene island isolation on genetic divergence in species with limited dispersal abilities, while some species exhibited inter-island migration by the Middle Pleistocene.
(Published online 20 January, 2025; Print publication 30 April, 2025)
後期中新世以降の島嶼集団ダイナミクス:中琉球に固有の哺乳類 3 属(Pentalagus,Diplothrix,および Tokudaia)における比較系統地理学的研究
琉球列島は後期中新世以降,島間の連結と分断を繰り返してきた複雑な歴史を有している.特に多くの固有種が生息する中琉球では,過去数百万年にわたる島嶼構造の変化の下,生物がどのように進化してきたかについて,未だ多くの疑問が残されている.本研究では,中琉球に属レベルで固有の 5 種の哺乳類(アマミノクロウサギ Pentalagus furnessi,ケナガネズミ Diplothrix legata,およびトゲネズミ類 Tokudaia 属の 3 種)を対象に,ゲノムワイドな一塩基多型(SNP)およびミトコンドリア DNA 変異に基づいた比較系統学的・系統地理学的解析を行った.SNP およびミトコンドリア DNA の双方の解析結果から,上記の 3 属いずれでも,各島集団(奄美大島,徳之島,および沖縄島.ただしアマミノクロウサギは沖縄島に生息しない)はそれぞれ独立した系統であることが確認され,奄美大島の集団の遺伝的多様性が最も高いことが明らかとなった.島集団間の分岐時期は,アマミノクロウサギとケナガネズミでは中期更新世と推定されたのに対し,トゲネズミ類では後期中新世から前期更新世に遡ると推定された.以上の結果は,他の陸生動物の先行研究の結果も合わせて考えると,分散能力が限定されている種については更新世以前に生じた島嶼の隔離が遺伝的分岐に重要な役割を果たした一方で,一部の種においては中期更新世まで島間の移動が生じていたことを示している.
2026年4月18-20日
「アマミノクロウサギミュージアムQuruGuru開館1周年記念イベント」に出席します.会場は,奄美大島大和村水と森公園(クルグル館の前),期間は2026年4月18-20日.
2026年4月9日
『「ちかくにあるいのちの図鑑 ウサギ」絵本』5月15日発売(予定)の入稿完了.イタリアの作家さん(絵と文)の絵本の日本語版の監修を担当しました.内容や表現などのファクトチェックと修正を行いました.発行は京都市の化学同人,編集は大津市のアチェロ社です.両社とも,興味深く面白そうな書籍や絵本(ヨーロッパの絵本など)を多く発刊されています.のぞいてみてください.